研究方向
生命的分子機器 如果我們把復(fù)雜的生命活動過程分解為一個個單獨的物理、化學(xué)過程，這些物理、化學(xué)過程依賴于細胞內(nèi)各式各樣結(jié)構(gòu)復(fù)雜而有序的分子機器來進行，這些分子機器由蛋白質(zhì)、核酸、糖類、脂類等生物大分子或這些大分子的復(fù)合物構(gòu)成的。正是依靠了生命體內(nèi)微觀世界中眾多的分子機器的有序運轉(zhuǎn)、協(xié)同配合，生命體才有了活力。 構(gòu)成生物大分子的原子主要是氫、碳、氮、氧、磷、硫以及少量的金屬原子，這些普通的原子一旦在三維空間中特定地排列，就使得這個生物大分子成為一個分子機器，能執(zhí)行特定的生命功能。形象地說，本課題組的研究方向就是要把細胞中重要的分子機器打開來看一看，了解什么樣的結(jié)構(gòu)導(dǎo)致這些分子機器具有特定的功能，這些功能又是如何精確地被其它外界因素調(diào)控的。通過研究結(jié)構(gòu)與功能的關(guān)系來回答一些重要的生物學(xué)問題。這些重要生物學(xué)問題的回答一方面是充分認識生命現(xiàn)象本質(zhì)，掌握生命活動規(guī)律所必須的，具有重大的科學(xué)和認識價值。另一方面，這些研究成果可以應(yīng)用于社會生產(chǎn)，對人類的經(jīng)濟生活產(chǎn)生重大影響。
新藥申請
在Syrrx公司（Syrrx公司于2005年2月7日為日本武田制藥公司收購成為武田-圣地亞哥分部）擔(dān)任科學(xué)家期間，作為基于結(jié)構(gòu)的糖尿病藥物設(shè)計主要參與人之一，所設(shè)計的高選擇性雙肽蛋白酶?4抑制劑已通過臨床試驗。武田制藥于2008年1月7日向美國食品與藥物管理局（FDA）遞交2型糖尿病新藥申請(藥名alogliptin)，2010年6月27日美國食品與藥物管理局（FDA）以所提供數(shù)據(jù)不足為理由拒絕批準(zhǔn)此新藥申請，武田制藥決定增補數(shù)據(jù)預(yù)期在兩年之內(nèi)再次遞交此新藥申請；此外，武田制藥與2008年9月23日向美國食品與藥物管理局（FDA）遞交2型糖尿病復(fù)方藥新藥申請(藥名alogliptin/Actos)。 代表性論文 1. Kong C, Zeng W,Ye S, Chen L, Sauer D, Lam Y, Derebe M, Jiang Y (2012) Distinct Gating Mechanisms revealed by the structures of a multi-ligand gated Kchannel.eLIFE, doi: 10.7554/eLife.00184. Epub 2012 Dec 13 2. Dong W, Lu W,McKeehan WL, Luo Y,Ye S*,(2012).Structural Basis of Heparan Sulfate-Specific Degradation by Heparinase III.Protein Cell,3:950-61 3.Ye S*, Li Y, Jiang Y.(2010).Novel insights into ion selectivity from high resolution structures of an open Kchannel pore.Nat Struct Mol Biol,17:1019-23. 4. Wu Y, Yang, Y,Ye S, Jiang Y. (2010).Structure of the Gating Ring from the Human High-conductance Ca2+-gated K+ Channel.Nature,466:393-7. 5.Ye S, Li Y, Chen L, Jiang Y.(2006).Crystal structures of a Ligand-free MthK gating ring: Insights into the ligand gating mechanism of Kchannel.Cell,126:1161-73. 6. Shi N,Ye S, Alam A, Chen L, Jiang Y.(2006).Atomic Structure of a Naand KConducting Channel.Nature440:570-574. 7.Ye S, Cech AL, Belmares R, Bergstrom RC, Tong Y, Corey DR, Kanost MR, and Goldsmith EJ.(2001).The structure of a Michaelis Serpin-Protease Complex.Nat Struct Biol,8:979-983 8.Ying Li, Jen Hsin, Lingyun Zhao, Yiwen Cheng, Weina Shang, Kerwyn Casey Huang, Hong-Wei Wang, Sheng Ye.(2013).FtsZ Protofilaments Use a Hinge-Opening Mechanism for Constrictive Force Generation.Science,341:392-395.
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